Ammonium ist das Ergebnis der Stickstoffmineralisation, in der gebundener Stickstoff aus Futterresten und Exkrementen durch Bakterien in NH4+ umgewandelt wird. In Abhängigkeit vom pH-Wert liegt im Wasser ein Gleichgewicht zwischen Ammonium-Ionen NH4+ und Ammoniak NH3 vor. Bei pH-Werten kleiner als 7 dominieren die weitgehend unbedenklichen Ammonium-Ionen, während bei pH-Werten über 7 zunehmend Ammoniak auftritt. Ammoniak ist sehr gefährlich, da es die Atmung von Lebewesen beeinträchtigt. Es dringt leicht in die Zellen ein, wodurch der pH-Wert ansteigt und lebenswichtige Funktionen blockiert werden. In einem gesunden und eingefahrenen Becken werden Ammonium-Ionen schnell durch nitrifizierende Bakterien über Nitrit zu Nitrat oxidiert. Ist diese Prozesskette gestört, kann es zu einem plötzlichen Anstieg der Ammonium-Konzentration kommen. Daher sollte die Ammonium/Ammoniak-Konzentration besonders in neuen Becken überprüft werden.
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Mit diesem Test wird die Ammonium/Ammoniak-Gesamtkonzentrationgemessen. Für den Süßwasserbereich gilt unter den üblichen Bedingungen eine Ammonium / Ammoniak-Gesamtkonzentration von 0,1 mg/l als normal, wobei eine Obergrenze von 0,5 mg/l nicht überschrittenwerden sollte. Im Meerwasser sollte die Ammonium/Ammoniak-Gesamtkonzentration kleiner als 0,05 mg/l sein. Entscheidend ist jedoch die reine Ammoniak-Konzentration, die sich in Abhängigkeit von der Temperatur und dem pH-Wert aus der Ammonium/Ammoniak-Gesamtkonzentration ergibt.
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